Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCMH1Q96GD3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCMH1Q96GD3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms