Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CFAP36Q96G28 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CFAP36Q96G28 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms