Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM44Q96DX7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms