Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms