Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NXNL1Q96CM4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXNL1Q96CM4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms