Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSUN4Q96CB9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms