Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC74AQ96AQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC74AQ96AQ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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