Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA4DQ92854 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms