Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRUQ92729 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRUQ92729 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRUQ92729 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms