Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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RABGGTAQ92696 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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