Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN4Q92575 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms