Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms