Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C15orf40Q8WUR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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