Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms