Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms