Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELQQ8TDG4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms