Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00116Q8NCU8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms