Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLGALT1Q8NBJ5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms