Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSL3Q8N5Y2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3Q8N5Y2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms