Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM61Q8N0U2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms