Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPUSD2Q8IZ73 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms