Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC65Q8IXS2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms