Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOT2Q8IXI1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOT2Q8IXI1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms