Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC50Q8IVM0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms