Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms