Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM139Q8IV31 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms