Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms