Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKAP1Q86WV1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms