Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms