Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms