Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTF1AQ7RTS3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms