Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMIM5Q71RC9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMIM5Q71RC9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms