Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP31Q70CQ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms