Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM179Q6ZVK1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM179Q6ZVK1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms