Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms