Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TFAP2EQ6VUC0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TFAP2EQ6VUC0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms