Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms