Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTR9Q6PD62 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms