Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms