Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms