Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RWDD4Q6NW29 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms