Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWSAP1Q6NVH7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms