Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms