Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD40Q6AI12 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms