Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX8Q68G74 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms