Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SUSD4Q5VX71 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms