Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF3Q5VWG9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms