Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BROXQ5VW32 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BROXQ5VW32 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms