Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATRNL1Q5VV63 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRNL1Q5VV63 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms