Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3CQ5T2N8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms